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नेक्स्ट जनरेशन सीक्वेंसिंग

Lokesh Pal September 03, 2024 03:06 41 0

संदर्भ

राष्ट्रीय पशु जैव प्रौद्योगिकी संस्थान (NIAB) स्वदेशी मवेशियों की नस्लों की पहचान और संरक्षण के लिए ‘नेक्स्ट जेनरेशन सीक्वेंसिंग’ (NGS) और जीनोटाइपिंग तकनीक का उपयोग कर रहा है।

BioE3 नीति के साथ संरेखण

  • NIAB का अनुसंधान ‘BioE3’ नीति के अनुरूप है, जो अर्थव्यवस्था, पर्यावरण और रोजगार को बढ़ावा देने के लिए जैव प्रौद्योगिकी पर केंद्रित है।

NIAB

  • यह हैदराबाद, तेलंगाना में स्थित है और वर्ष 2010 में स्थापित किया गया था।
  • NIAB पशु आनुवंशिकी और जैव प्रौद्योगिकी में उन्नत अनुसंधान पर ध्यान केंद्रित करता है।
  • पशु स्वास्थ्य और उत्पादकता को बढ़ाने का लक्ष्य रखता है।
  • जीनोमिक्स, प्रजनन जैव प्रौद्योगिकी, संक्रामक रोगों और जैव सूचना विज्ञान में अनुसंधान करता है।
  • नवीनतम टीके, निदान और चिकित्सीय अणु विकसित करता है।

    • उद्योग जगत को सहयोग प्रदान करना: संस्थान का उद्देश्य पशुधन आधारित अर्थव्यवस्था को बदलने में उद्योगों और स्टार्टअप को सहायता प्रदान करना है।
      • इस कदम के पीछे मुख्य लक्ष्य जैव-प्रौद्योगिकीय हस्तक्षेप के माध्यम से भारत को जैव-विनिर्माण में वैश्विक नेतृत्वकर्ता के रूप में स्थापित करना है।

‘नेक्स्ट जेनरेशन सीक्वेंसिंग’ (NGS) 

  • NGS एक आधुनिक DNA अनुक्रमण विधि है, जिसने जीनोमिक अनुसंधान को बदल दिया है। 
  • यह DNA और RNA के तीव्र और लागत प्रभावी अनुक्रमण की अनुमति देता है।
    • यह इसे सेंगर सीक्वेंसिंग (Sanger sequencing) जैसी पुरानी तकनीकों की तुलना में अधिक तेज और सस्ता विकल्प बनाता है।

  • NGS आनुवंशिक विविधताओं की एक विस्तृत शृंखला की पहचान कर सकता है, जिसमें एकल न्यूक्लियोटाइड बहुरूपता (SNP), सम्मिलन, विलोपन और जीनोम में संरचनात्मक परिवर्तन शामिल हैं।
  • NGS के लाभ
    • गति: बड़ी मात्रा में DNA/RNA को जल्दी से अनुक्रमित करता है।
    • लागत-प्रभावी: अनुक्रमण लागत कम होती है।
    • व्यापक: विभिन्न आनुवंशिक विविधताओं का पता लगाता है।
    • स्केलेबल: छोटे से लेकर बड़े अध्ययनों के लिए अनुकूलनीय।

जीनोटाइपिंग (Genotyping)

  • जीनोटाइपिंग एक व्यक्ति के DNA अनुक्रम का विश्लेषण करके आनुवंशिक अंतरों की पहचान करने की प्रक्रिया है।

  • DNA अनुक्रमों की तुलना: इसमें किसी व्यक्ति के डीएनए की तुलना किसी अन्य व्यक्ति के अनुक्रम या संदर्भ अनुक्रम से की जाती है ताकि वंशानुगत ‘एलील’ का पता लगाया जा सके।
  • जीनोटाइपिंग का पारंपरिक उपयोग: परंपरागत रूप से, जीनोटाइपिंग व्यक्तिगत जीन को परिभाषित करने पर ध्यान केंद्रित किए बिना, आणविक उपकरणों के साथ जैविक आबादी को वर्गीकृत करने के लिए डीएनए अनुक्रमों का उपयोग करता है।

NGS और जीनोटाइपिंग प्रौद्योगिकी के बीच अंतर

पहलू नेक्स्ट जनरेशन सीक्वेंसिंग (NGS) जीनोटाइपिंग प्रौद्योगिकी
परिभाषा संपूर्ण जीनोम या लक्षित क्षेत्रों में न्यूक्लियोटाइड का क्रम निर्धारित करता है। विशिष्ट आनुवंशिक विविधताओं की पहचान करता है (जैसे, SNPs)
दायरा संपूर्ण जीनोम, एक्सोम या लक्षित क्षेत्र लक्षित क्षेत्र या विशिष्ट वैरिएंट
डेटा आउटपुट व्यापक अनुक्रम डेटा विशिष्ट आनुवंशिक मार्कर
रिज़ॉल्यूशन उच्च रिज़ॉल्यूशन, विस्तृत जानकारी निम्न रिज़ॉल्यूशन, ज्ञात वैरिएंट पर केंद्रित
अनुप्रयोग शोध, व्यक्तिगत चिकित्सा, विकासवादी अध्ययन रोग संबंधी अध्ययन, आनुवंशिक जाँच
लागत सामान्यतः उच्चतर आमतौर पर कम
अवधि लंबी प्रसंस्करण अवधि लंबी प्रसंस्करण अवधि
जटिलता अधिक जटिल डेटा विश्लेषण सरल डेटा विश्लेषण
उदाहरण होल जीनोम सीक्वेंसिंग (WGS), एक्सोम सीक्वेंसिंग SNP जीनोटाइपिंग, HLA टाइपिंग

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